معلومة

هل ترتيب الأحماض الأمينية في البروتين مهم للتغذية؟

هل ترتيب الأحماض الأمينية في البروتين مهم للتغذية؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

لنفترض أن هناك نظامين غذائيين ، يتكونان من بروتينات مختلفة تمامًا. إذا قمت بتقسيم جميع البروتينات من يوم واحد من كل نظام غذائي ، فستحصل على نفس مجموعة الأحماض الأمينية ونفس عدد كل منها. افترض أن كل شيء آخر يتعلق بالنظام الغذائي هو نفسه.

هل سيكون لهذه الحميات نفس التأثير على تركيبة البروتين في جسمك؟ عديد ببتيدات مختلفة ، ولكن بشكل عام المونومرات متطابقة. هل يكسر جسمك البروتينات تمامًا أم سيعيد استخدام بعض سلاسل الأحماض الأمينية؟


يحدد ترتيب الأحماض الأمينية بنية البروتين والتي بدورها يمكن أن تحدد مدى سهولة هضم البروتين. لا أستطيع التفكير في مثال الآن. لم يتم التحقق مما إذا كان بروتينان مختلفان تمامًا لهما تركيبة متطابقة. ومع ذلك ، هذا ليس مفاجئًا حقًا. في الكيمياء ، من المعروف أن الأيزومرات المختلفة لها خصائص فيزيائية مختلفة إلى حد كبير.

لذلك إذا كان للبروتينين قابلية هضم مختلفة ، فسيكون لهما قيم غذائية مختلفة.

فيما يتعلق بهضم البروتين والتغذية. يتم بناء بروتينات جديدة من الأحماض الأمينية الفردية وليس الأوليغومرات المشكلة مسبقًا. اقرأ عن الترجمة. لذلك في مرحلة ما ، يجب تقسيم البروتين المبتلع بالكامل إلى أحماض أمينية.


ترتيب ثلاثي الأبعاد للأحماض الأمينية

عند رسم الترتيب ثلاثي الأبعاد للأحماض الأمينية ، تحصل على شكل رباعي السطوح. ولكن كيف تعرف أي مجموعة دالة تقع في السند العلوي؟

ليس هذا ما تبحث عنه؟ جرب & hellip

وهذا أقل شيء سيتعين على ستيف ديفيز تغطيته في السنة الأولى حينها.

لم أفهم أبدًا سبب توليه لتدريس "الكيمياء العضوية للكيميائيين الذين نسوا المستوى الأول". أوه ، والكيمياء الحيوية أيضا 'بالطبع. إذا كان هناك أي معنى في العالم ، فستتخلص من هذا النوع من الدورة التدريبية على المحاضرين الجدد الذين لم تعجبك. أنت بالتأكيد لن تفكر ، كرئيس قسم ، أن تفعل ذلك بنفسك. ثماني محاضرات بلادة لا يمكن تصورها

يقوم باختيار أغرب الدورات. دورة نكتة في السنة الأولى ، حلقات غير متجانسة تكميلية للسنة الثانية ، مواد عضوية اختيارية للسنة الثالثة (تعرف أيضًا بكيفية الغش في عضوي باستخدام Cr (CO)3، Fe (CO)3 والغريب "Fp").

كدت أميل إلى الذهاب لمقابلته للحديث عن مشاريع السنة الرابعة ، لكنني اعتقدت أن شعر الوجه قد يكون مصدر إلهاء

يشترك 20 من الأحماض الأمينية البروتينية الشائعة في نفس الترتيب عند عرضها مع N على اليسار و C على اليمين ، كما هو معتاد ، ستظهر مجموعة R من الرسم. على سبيل المثال ، السيستين.

تشترك 20 من الأحماض الأمينية البروتينية الشائعة في نفس الترتيب عند عرضها مع N على اليسار و C على اليمين ، كما هو معتاد ، ستظهر مجموعة R من الرسم. على سبيل المثال ، السيستين.

كيف ترسم الهيكل ثلاثي الأبعاد لهذا الجزيء؟

هذا يعتمد على ما تريد نقله. هناك طريقتان سأستخدمهما ، وكلاهما معروضين أسفل الهيكل الهيكلي الكامل هو كيف سأختار شخصيًا عرض هذا الهيكل. لا يعني ذلك أنك لم تحدد الكيمياء الفراغية ، لذا فقد افترضت أنها الأيزومر R.

سيكون من الزائد بعض الشيء رسم تكوينات كاملة لكل كربون ، كما هو متضمن في استخدام المخططات الهيكلية.

(أرفق الصورة لأنها تم تفجيرها بطريقة ما إلى حجم سخيف عندما حفظتها. يجب أن تكون قادرًا على عرضها بالنقر فوق المرفق أدناه)

(المنشور الأصلي بواسطة كايرول)
هذا يعتمد على ما تريد نقله. هناك طريقتان سأستخدمهما ، وكلاهما معروضين أسفل الهيكل الهيكلي الكامل هو كيف سأختار شخصيًا عرض هذا الهيكل. لا يعني ذلك أنك لم تحدد الكيمياء الفراغية ، لذا فقد افترضت أنها الأيزومر R.

سيكون من الزائد بعض الشيء رسم تكوينات كاملة لكل كربون ، كما هو متضمن في استخدام المخططات الهيكلية.

(أرفق الصورة لأنها تم تفجيرها بطريقة ما إلى حجم سخيف عندما حفظتها. يجب أن تكون قادرًا على عرضها بالنقر فوق المرفق أدناه)


المواد والأساليب

بلورة.

تم التعبير عن جزء من IRS-1 البشري (المخلفات 4-271) على شكل جلوتاثيون س-بروتين انصهار ترانسفيراز (GST) في الإشريكية القولونية ومعزولة بواسطة كروماتوغرافيا تقارب الجلوتاثيون - الاغاروز. تمت تنقية جزء أصغر قليلاً (4-267) ، تم الحصول عليه عن طريق شق بروتين الاندماج المُستخلص مع الثرومبين البقري (10 وحدات / مجم بروتين) (13) ، بواسطة كروماتوجرافيا العمود Mono-Q (Amersham Pharmacia Biotech). نمت البلورات في درجة حرارة الغرفة عن طريق انتشار البخار في قطرات معلقة تحتوي على أحجام متساوية من محلول البروتين (10 مجم / مل في 25 ملي مولار ، ودرجة الحموضة 8.0 ، و 200 ملي مول كلوريد الصوديوم ، و 10 ملي مولار DTT) ومحلول الخزان (1.7 م فوسفات الصوديوم ، الرقم الهيدروجيني. 7.5 و 10 ملم DTT). وصلت البلورات إلى أبعاد قصوى تبلغ 0.2 × 0.2 × 0.3 ملم على مدار عدة أيام ، وهي تنتمي إلى مجموعة الفضاء السداسية P65 (أ = ب = 120.44 ، ج = 79.60 Å) وتحتوي على جزيئين لكل وحدة غير متماثلة. تم نقل البلورات تدريجياً إلى محلول خزان يحتوي على 20٪ جلسرين لمجموعات البيانات المبردة.

تحديد الهيكل.

تم تسجيل بيانات الانعراج باستخدام كاشف لوحة الصور MarResearch المركب على مصدر الأنود الدوار Elliot GX-13 مع بصريات المرآة. تم دمج صور التذبذب (0.5 درجة) وقياسها باستخدام برامج marxds و marscale (14). تم تحديد الهيكل من خلال مزيج من الاستبدال المتماثل الفردي (SIR) والاستبدال الجزيئي (MR). تم الحصول على ثلاث مجموعات بيانات مستقلة من بلورات مفردة تم تحضينها لمدة 12 ساعة في سائل أم يحتوي على 1 ملي مولار من نترات ميثيل الزئبق. تم تحديد مواقع الذرة الثقيلة بواسطة باترسون واختلاف طرق فورييه مع حزمة برنامج CCP4 (15). تم تنقيح معلمات الذرة الثقيلة وتم حساب المراحل باستخدام البيانات الشاذة mlphare وأدرجت في حسابات المرحلة (15). تم الحصول على حلول لا لبس فيها لعمليات البحث الدورانية والتحويلية لجزء مجال PTB من الهيكل باستخدام مجال IRS-1 PTB (13) كنموذج بحث والبرنامج أكثر من ذلك (16). تم دمج معلومات طور SIR و MR باستخدام برنامج سيجما (15). تم تحسين خرائط كثافة الإلكترون عن طريق التناظر غير البلوري للفضاء الحقيقي بمتوسط ​​باستخدام برنامج dm (17). سمح الهيكل العظمي للخريطة المحسّنة بالعظام (18) بنموذج الكربون ألفا لمجال PH pleckstrin ليكون مناسبًا كجسم صلب مجاور لمجال PTB. تم تنقيح النموذج باستخدام قيود التناظر غير البلوري ، التلدين المحاكي ، والصقل الموضعي ، وتم تجديده يدويًا باستخدام البرنامجين xplor (19) و o (18). تمت إضافة جزيئات الماء يدويًا. يتضمن النموذج النهائي جميع البقايا من مجالات PH (12-116) و PTB (160-264) و 90 جزيء مذيب. تكون البقايا 117-159 المقابلة للرابط بين المجالات مضطربة.

فحوصات ملزمة.

أجريت تحليلات ربط الفوسفات PI كما هو موصوف (20). اصطناعي ، قابل للذوبان في الماء [3 H] ثنائي أوكتانويل PI (3،4،5)ص3 تم تحضين (5 × 10 7 cpm / mmol) (21) (1 ساعة ، 21 درجة مئوية) مع حبات الجلوتاثيون agarose التي تحتوي على ≈3.5 ملي مولار من أحد بروتينات الانصهار GST / IRS-1 البشرية التالية: GST / PH-PTB ( بقايا 4-271) ، مجال GST / PTB (144-316) ، مجال GST / PH (13-116) ، أو GST وحده ، في محلول Hepes 30 ملي مولار ، ودرجة الحموضة 7.0 ، تحتوي على 100 ملي كلوريد الصوديوم ، 1.0 ملي مولار EDTA ، و 0.02 ٪ NP-40. تم استخدام الحلول الطافية لتحديد تقاربات الربط وفقًا للمعادلة [ملزمة] = بالأعلى × [مجاني] / (كد + [مجاني]) ، حيث تشير [ملزمة] و [حرة] إلى تركيزات ملزمة وحرة لـ [3 H] PI (3،4،5)ص3, بالأعلى هو المبلغ المرتبط بشروط التشبع ، و كد هو ثابت التفكك.

طرق استخدام BIAcore Biosensor (Amersham Pharmacia) لتحديد كد تم وصف القيم (22). تم تجميد الببتيدات إلى شريحة CM5 من خلال المجموعة الأمينية ɛ من Lys الطرفية C. تم تأكيد إمكانية الوصول إلى الببتيد عن طريق الارتباط بالأجسام المضادة لمضادات الفوسفوتيروزين (4G10). تم قياس الارتباط بين بروتينات مجال PH-PTB و PTB (بدون اندماج) والببتيد IRpY960 (Ac-LYASSNPApYLSASDVK-NH2) ونظيرتها المخفوقة (Ac-YLSDVASLpYASPANSK-NH2). تم تحليل البيانات باستخدام معادلة Eadie Hofstee ، cRU = (−cRU / [بروتين])كد + cRUالأعلى (22).


طريقة الميراث

مرض الخلايا المنجلية هو اضطراب وراثي وراثي ، موروث في نمط وراثي جسمي متنحي مما يعني أن المصابين به لا يرثونه إلا من أبوين لديهم سمات المرض. أولئك الذين لديهم سمات هم أولئك الذين لديهم الهيموغلوبين AS. لا تظهر عليهم أي أعراض سريرية ويعيشون حياة طبيعية. ومع ذلك ، إذا كان لدى شخصين يمتلكان هذه السمات أطفالًا بيولوجيين معًا ، فإن لديهم فرصة بنسبة 25٪ لكل حمل لإنجاب طفل مصاب باضطراب فقر الدم المنجلي.

توضح الصورة أعلاه النتيجة المحتملة للأنماط الجينية لكل حمل. لا توجد طريقة حاليًا للتنبؤ بكيفية تحديد الجسم للهيموجلوبين الذي سيولد به الطفل. للمجموعة المذكورة أعلاه ، AA- 25٪ لكل حمل ، AS- 50٪ ، SS-25٪. ليس في ترتيب معين. هذا يعني أنه يمكن للأزواج الذين هم كلا الناقلين الحصول على كل من AA أو كل AS أو كل SS أو أي مجموعة.


هل ترتيب الأحماض الأمينية في البروتين مهم للتغذية؟ - مادة الاحياء

تغذية البالغين ولياقة الفراشة: آثار جودة النظام الغذائي على الإنتاج الإنجابي ، وتكوين البيض ، ونجاح فقس البيض

5 1 10 http://www.frontiersinzoology.com/content/5/1/10

2008 Geister et al المرخص له BioMed Central Ltd. بأي وسيلة ، بشرط الاستشهاد بالعمل الأصلي بشكل صحيح.

في Lepidoptera ، كان يعتقد تاريخياً أن الفراشات البالغة تعتمد بشكل أساسي على العناصر الغذائية المشتقة من اليرقات للتكاثر والصيانة الجسدية. ومع ذلك ، فإن الدراسات الحديثة تسلط الضوء على التفاعلات المعقدة بين احتياطيات التخزين ودخل البالغين ، وأن هذا الأخير قد يساهم بشكل كبير في التكاثر. تم تقييم تأثيرات النظام الغذائي للبالغين بشكل عام من خلال تحديد عدد و / أو حجم البيض المنتج ، في حين تم إهمال عواقبها على تكوين البيض وحيوية النسل (كما هو الحال بشكل عام بالنسبة للحشرات). نحن هنا نركز بشكل خاص على هذه القضايا الأخيرة باستخدام الفراشة الاستوائية التي تغذي الفاكهة Bicyclus anynana ، والتي تعتمد بشكل كبير على الكربوهيدرات المشتقة من البالغين للتكاثر.

كان للنظام الغذائي البالغ للإناث B. anynana تأثير واضح على الخصوبة وتكوين البيض ونجاح فقس البيض ، حيث تتغذى الفراشات على التغذية المعقدة لفاكهة الموز التي تحقق أداءً أفضل. أدت إضافة الفيتامينات والمعادن إلى نظام غذائي قائم على السكروز إلى زيادة الخصوبة ، ولكن ليس النسل. جميع المجموعات الأخرى (محلول السكروز العادي ، محلول السكروز المخصب بالدهون أو الخميرة) كان لها خصوبة أقل ونجاح في فقس البيض مقارنة بمجموعة الموز. كانت الاختلافات واضحة بشكل خاص في وقت لاحق من الحياة ، مما يُفترض أنه يشير إلى استنفاد العناصر الغذائية الأساسية في الإناث التي تتغذى على السكروز. لم تكن تأثيرات غذاء البالغين على تكوين البيض مباشرة ، مما يشير إلى تفاعلات معقدة بين مركبات معينة. كانت هناك بعض الأدلة على أن إجمالي محتوى البيض من الطاقة والمياه كان لهما علاقة بنجاح الفقس ، بينما لا يبدو أن محتوى بروتين البيض والدهون والجليكوجين والكربوهيدرات الحرة يحد من التطور الناجح.

توضح الأنماط الموضحة هنا مدى تعقيد تخصيص الموارد الإنجابية في B. anynana ، والحاجة إلى النظر في تكوين البيض وصلاحية النسل عند محاولة تقدير آثار تغذية البالغين على اللياقة البدنية في هذه الفراشة والحشرات الأخرى.

الخصوبة وحجم البويضة ونجاح الفقس

أثر النظام الغذائي للبالغين معنويا على خصوبة إناث ب 4,250 = 6.1 ، P & lt 0.001). حققت مجموعة الموز أعلى عدد من البيض (86.2 & # 177 4.5) تليها مجموعة MV (71.6 & # 177 4.1) ، بينما وضعت مجموعات العلاج المتبقية عددًا أقل بكثير من البيض وكان لا يمكن تمييزها إحصائيًا (63.8 & # 177 2.3 Tukey HSD بعد الشكل ANOVA 1). في حين أن الخصوبة المبكرة كانت متشابهة إلى حد ما عبر مجموعات العلاج (باستثناء القيم الأعلى قليلاً لمجموعة الموز) ، كان التباين في الخصوبة المتأخرة أعلى حيث أظهرت مجموعتي الموز و MV قيمًا أعلى بكثير من جميع المجموعات الأخرى (معاملة كبيرة & # 215 وقت التفاعل F 4,250 = 2.5 ، ف = 0.041). عمومًا ، أنتجت الإناث عددًا أكبر من البيض مبكرًا مقارنةً بأواخر الحياة (F 1,250 = 256.3 ، P & lt 0.001). لم تختلف كتلة البيض الجافة بشكل كبير عبر مجموعات العلاج (F 4,129 = 0.260 ، P = 0.903) ، لكنها كانت أقل بشكل عام (انخفاض بنسبة 11 ٪ تقريبًا) في وقت متأخر عن الحياة السابقة (F 1,129 = 23.8 ، P & lt 0.001 علاج & # 215 وقت التفاعل: F 4,129 = 0.66 ، P = 0.624 شكل 1).

عدد البيض والكتلة الجافة ونجاح فقس البيض

عدد البيض والكتلة الجافة ونجاح فقس البيض. متوسط ​​عدد البيض (أ) ، الكتلة الجافة للبيض (ب) ، ونجاح فقس البيض (ج) للإناث بيسكلوس أنيانا فيما يتعلق بالتغذية البالغة وعمر الأنثى. مبكرًا: بيض من الأيام 3 & # 82114 من تأخر عمر البالغين: بيض من اليوم 16 & # 821117. الموز: دهن الموز الرطب: 20٪ سكروز زائد 1 Vol٪ زيت زيتون MV: 20 Vol٪ سكروز بالإضافة إلى المعادن والفيتامينات السكر: 20٪ خميرة السكروز: 20٪ سكروز بالإضافة إلى خميرة الخباز.

كان نجاح فقس البيض بشكل عام أعلى بشكل ملحوظ في الموز مقارنة بجميع المجموعات الأخرى ، حيث لا يمكن تمييز المجموعات الأربع الأخيرة إحصائيًا (Tukey HSD F 4,213 = 10.8 ، P & lt 0.001 شكل 2). نتج الأداء العام الأفضل لمجموعة الموز بشكل أساسي عن نجاح الفقس المرتفع باستمرار (الحياة المبكرة: 82.4 & # 177 3.6٪ ، الحياة المتأخرة: 71.9 & # 177 4.6٪) ، بينما انخفض نجاح الفقس في مجموعات العلاج الأخرى بشكل ملحوظ من

30٪ (وقت متأخر: F 1,213 = 177.3 ، P & lt 0.001 معالجة & # 215 مرة: F 4,213 = 6.2 ، P & lt 0.001 شكل 2).

تكوين البيض النسبي. ماء البيض النسبي (أ) ، والدهون (ب) ، والبروتين (ج) ، والجليكوجين (د) ومحتوى الكربوهيدرات المجاني (يعني & # 177 1 SE) للإناث باسيكلس أننانا فيما يتعلق بتغذية البالغين وعمر الإناث. مبكرًا: بيض من الأيام 3 & # 82114 من تأخر عمر البالغين: بيض من اليوم 16 & # 821117. لتفسيرات العلاجات الغذائية ، انظر الشكل 1.

عبر فترات العلاج وأخذ العينات (أي بالنسبة للبيض المنتج مبكرًا أو متأخرًا في الحياة) ، كان البيض يتكون في الغالب من الماء (84.1 & # 177 0.24٪) ، تليها الدهون (6.8 & # 177 0.11٪) ، والبروتينات (6.5 & # 177 0.19) ٪) ، الجليكوجين (2.1 & # 177 0.05٪) والكربوهيدرات الحرة (0.4 & # 177 0.02٪). كان محتوى ماء البيض أعلى بشكل ملحوظ في الموز عنه في مجموعة الخميرة ، بينما لم تكن جميع المقارنات الزوجية الأخرى معنوية (Tukey HSD بعد ANOVA F 4,129 = 2.5 ، P = 0.049 الشكل 3). بشكل عام ، كان محتوى الماء أقل بشكل ملحوظ في وقت لاحق عن البيض السابق (F. 1,129 = 5.1 ، P = 0.026 علاج & # 215 وقت التفاعل: F 1,129 = 0.6 ، ف = 0.677). أثر النظام الغذائي للبالغين معنويا على دهون البيض (F. 4,131 = 13.4 ، P & lt 0.001 شكل 3) ، بروتين (F 1,129 = 10.7 ، P & lt 0.001 شكل 4) ، جليكوجين (F 4,131 = 4.1 ، P & lt 0.001 الشكل 4) ومحتوى الكربوهيدرات الحر (F 4,130 = 10.1 ، P & lt 0.001 شكل 5).

محتوى طاقة البيض. محتوى طاقة البيض لكل 1 مجم كتلة جافة (A) ولكل بيضة (B) (يعني & # 177 1 SE) للإناث Bicyclus أننانا فيما يتعلق بتغذية البالغين وعمر الإناث. مبكرًا: بيض من اليوم 3 & # 82114 من تأخر عمر البالغين: بيض من اليوم 16 & # 821117. لتفسيرات العلاجات الغذائية ، انظر الشكل 1.

كان محتوى الدهون أعلى في مجموعتي الموز و MV مقارنة بجميع المعالجات الأخرى. علاوة على ذلك ، يزداد محتوى الدهون مع تقدم العمر الأنثوي (F. 4,130 = 62.0 ، P & lt 0.001) ، خاصة في مجموعات الموز و MV (العلاج & # 215 وقت التفاعل: F 4,130 = 17.7 ، P & lt 0.001). في المقابل ، كان محتوى البروتين أقل بشكل ملحوظ في الموز و MV مقارنة بالمجموعات الأخرى. بينما انخفض محتوى البروتين مع عمر الإناث في هاتين المجموعتين العلاجيتين ، فقد زاد في المجموعات الثلاث المتبقية (العلاج & # 215 التفاعل الزمني: F 4,130 = 19.0 ، P & lt 0.001). وفقًا لذلك ، لم يلاحظ أي تأثير زمني إجمالي لمحتوى البروتين (F 2,130 = 2.5 ، ف = 0.129).

انخفض محتوى الجيكوجين بشكل كبير في مجموعة الخميرة وانخفض بشكل ملحوظ في وقت متأخر مقارنة بالبيض المبكر (F 4,131 = 365.7 ، P & lt 0.001 معالجة & # 215 وقت التفاعل: F 4,131 = 2.2 ، ف = 0.071). كان محتوى الكربوهيدرات الحرة أعلى بكثير في معاملات السكر والخميرة. بينما كان محتوى الكربوهيدرات الحر بشكل عام ثابتًا إلى حد ما بمرور الوقت (F. 4,131 = 3.1 ، P = 0.082) ، فقد زاد بشكل كبير مع عمر الإناث في مجموعة السكر ، لكنه انخفض قليلاً في مجموعة الخميرة (العلاج & # 215 التفاعل الزمني: F 4,131 = 5.3 ، P & lt 0.001).


3. آليات التعرف الجزيئي

بعد النظر في بنية المستقبلات ، نطرح الآن السؤال التالي: كيف تعمل المستقبلات الشمية؟ هناك آليتان مقترحتان لخطوة التعرف الجزيئي الأولية: واحدة تعتمد فقط على الشكل وتفاعلات الترابط الضعيفة بين الرائحة والمستقبلات (والتي سنشير إليها باسم نظرية الالتحام) وتؤكد الأخرى أن المستقبلات يمكنها أيضًا تحديد الترددات الاهتزازية (التي نحن يجب أن يشار إليها باسم نظرية الذبذبات). تقر كلتا النظريتين بأن حدث التعرف يتطلب مستوى معينًا من المطابقة بين الرائحة والمستقبلات. يتضمن ذلك بعض التوافق مع الشكل (لتجنب التفاعلات البغيضة ذات الطاقة العالية) ، ومحاذاة المجموعات الذرية لدعم تفاعلات الترابط الضعيفة (لضمان أن وقت بقاء الرائحة في المستقبل كافٍ لتحريك التعرف). ومع ذلك ، فإنهم يختلفون في كيفية مساهمة ذلك في الاعتراف النهائي. تقترح نظرية الالتحام أن التغيير في تكوين المستقبل يتبع وصول جزيء يرتبط بقوة كافية ، والذي يبدأ بعد ذلك إشارة (ارتباط وإطلاق بروتين G ثلاثي في ​​الثدييات). تقترح النظرية الاهتزازية أن الإشارة يمكن أن تحدث فقط بمجرد أن يتعرف المستقبل على جزء من الطيف الاهتزازي للرائحة [21].

نقوم الآن بتحليل هذه الآليات بمزيد من التفصيل. نلاحظ أن مسألة الآلية ابتليت بالنظرية الاهتزازية لسنوات عديدة. في عام 1996 نشر لوكا تورين ورقة بحثية [21] اقترح فيها أن التحليل الطيفي للأنفاق غير المرنة هو آلية محتملة. هذه هي آلية الاهتزاز الأساسية التي تم النظر فيها هنا.

3.1. نظرية الالتحام

نقدم هنا لمحة موجزة للغاية عن الأفكار الرئيسية لنظرية الالتحام في الشم ، والتي تطورت بشكل مطرد على مدى عقود عديدة ، وتستمر حتى الوقت الحاضر [22]. كانت إحدى النظريات المبكرة من عام 1944 بسبب مونكريف [23] وبولينج في عام 1946 [24] هي أن رائحة الجزيء يتم تعريفها من خلال امتصاصه الانتقائي. تقبل كل نظرية معاصرة هذا بطريقة ما: المستقبلات لها شكل طبيعي ومترابط ، لذا فإن الروائح سترتبط حتماً بشكل انتقائي بمستقبلات مختلفة. في عام 1963 ، أنتج Amoore وجهة نظر أكثر إرشادًا [25] ، بناءً على فكرة مثيرة للاهتمام مفادها أنه قد تكون هناك رائحة "أولية" ، كما هو الحال بالنسبة للون. استنادًا إلى أكثر سبعة واصفات للرائحة انتشارًا ، رأى الرائحة كما تحددها مجموعة من الأشكال الجامدة. في حين أن التأثيرات الفراغية وثيقة الصلة بشكل واضح ، لم يعد يتم الاحتفاظ بمطابقة الشكل الصارمة حيث من المعروف أن المستقبلات الفردية تستوعب الروائح المتعددة [26 - 28].

في حين أننا لا نعرف التركيب الثانوي لأي مستقبلات شمية ، فإننا نعلم أن مستقبلات حاسة الشم لدى الفقاريات هي GPCRs [1]. نظرًا لأن هياكل بعض GPCRs الأخرى معروفة ، فقد كان من الممكن ، من خلال مزيج من التجربة والمحاكاة الحاسوبية ، العمل على عدد من الجوانب المتعلقة بكيفية عملها [29]. من الطبيعي أن نفترض أن المستقبلات الشمية تشترك في الخصائص مع هذه المستقبلات الأخرى.

ما هو واضح أيضًا ، مع ذلك ، هو أن الروابط النموذجية لمستقبلات الرائحة تختلف تمامًا عن الروابط النموذجية لـ GPCRs الأخرى ، من حيث التقارب والخصوصية. يوضح الشكل 1 ثلاثة روابط ، بترتيب تنازلي من التقارب والخصوصية من اليسار إلى اليمين. يتم إنشاء هذه المخططات بواسطة Poseview [30]. على اليسار يوجد نوربيوتين (pdb 1LDO) ، وهو يجند مع طاقة ربط شبه تساهمية لبروتين أفيدين. يصنع نوربيوتين سبعة روابط هيدروجينية مع البروتين ، يساهم كل منها ما بين 2 و 5 كيلو كالوري / مول. في المركز يوجد مركب GPCR رمزي ، نورادرينالين ، مصور بتفاعلاته مع مستقبلات الأدرينالية. يتم سرد خمس روابط هيدروجينية. إلى اليمين يوجد فرمون حشرة ، رباعي الكاديين-1-أول ، مرتبط بالبروتين المرتبط بالرائحة. من الآمن أن نفترض أن هذا البروتين قد تطور من أجل التقارب العالي ، حيث يمكن للحشرة أن تدرك الرائحة بتركيزات منخفضة. يختلف نمط التفاعلات تمامًا: تتفاعل معظم الرائحة بواسطة قوى التشتت ، ويشكل الهيدروكسيل الطرفي فقط رابطة هيدروجينية مفردة مع كربوكسيلات قريبة.


شاهد الفيديو: أفضل مصادر البروتين الطبيعية - أعلى نسبة أحماض أمينية (قد 2022).